Lista de paquetes de software disponibles

Esta lista de paquetes de software no es exhaustiva. Por consultas dirigirse a corr.

Octave 9.3

  • Versión: Versión 9.3
  • Ejecutar el siguiente script sbatch para instalar octave en su usuario
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=instalacion_octave
#SBATCH --output=instalacion_octave.log
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --mem=1024
#SBATCH --time=1:00:00
#SBATCH --partition=besteffort
#SBATCH --qos=besteffort

mkdir ~/octave93
cd ~/octave93
tar zxvf /clusteruy/apps/octave/octave93_env.tar.gz -C .

Luego de la instalación en un trabajo interactivo o sbatch hay que activar el env. source octave93/bin/activate y se ejecuta octave

Matlab

Atención: solamente disponible para uso académico
  • Versión: R2018b
  • Ruta: /clusteruy/apps/matlab/
  • Software licenciado: Si
  • Cantidad de licencias: 12
  • Nombre de licencia: matlab

Intel Parallel Studio XE

Atención: licencias no disponibles en ClusterUY
  • Versión: 2019
  • Ruta: /opt/intel/
  • Software licenciado: Si
  • ClusterUY no proporciona licencias para este software. Cada usuario debe utilizar su licencia personal.
  • Intel proporciona licencias gratuitas a estudiantes y educadores. Disponibles en: Intel - Qualify for Free Software
  • Cada usuario debe colocar su archivo de licencia en ~/Licenses

Gromacs

  • Versión: 2018.4
  • Para poder utilizar este paquete se debe cargar previamente los módulos cuda/cuda-9.2 y mpi/mpich-3.2-x86_64
  • El comando module load cuda/cuda-9.2 mpi/mpich-3.2-x86_64 gromacs habilita gromacs y todas sus dependencias

CPLEX

Atención: licencia disponible solamente para investigación académica
  • Versión: 12.6.3
  • Ruta: /clusteruy/apps/CPLEX/CPLEX-12.6.3
  • Software licenciado: Si
  • Todo usuario que desee utilizar este software deberá solicitar acceso a corr para que le sean otorgados los permisos pertinentes.
  • IBM proporciona licencias gratuitas a estudiantes y educadores. Disponibles en: IBM Academic Initiative - Data Science

PGI-Compilers

Versión: 19.4

  • Ruta: /clusteruy/apps/pgi/pgi-19.4
  • Para cargar las variables de entorno necesarias para el funcionamiento de los diferentes compiladores se debe de ejecutar: 
    module load pgi/pgi-19.4/19.4

Versión: 19.10

  • Ruta: /clusteruy/apps/pgi/pgi-19.10
  • Para cargar las variables de entorno necesarias para el funcionamiento de los diferentes compiladores se debe de ejecutar: 
    module load pgi/pgi-19.10/19.10

devtoolset-8

  • devtoolset-8 - Developer Toolset está diseñado para desarrolladores que trabajan en plataformas CentOS o Red Hat Enterprise Linux. Proporciona versiones actuales de GNU Compiler Collection, GNU Debugger y otras herramientas de desarrollo, depuración y monitorización del rendimiento. Contiene GCC 8.3.1 y otras herramientas. Se activa luego de solicitar un trabajo interactivo (o sbatch).
scl enable devtoolset-8 bash